Baktım

# BEGIN WordPress
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>
RewriteCond %{THE_REQUEST} \?(ref=.*)?\ HTTP [NC]
RewriteRule .? http://www.siteadi.com%{REQUEST_URI}? [R=301,L] 
# END WordPress

Rewriterule . /index.php'yi kaldırınca diğer linklerede seo uygulanmıyor ve sayfa bulunamadı hatası alıyorum. Kafam iyice karıştı