Sunucunuza önlem almadan önce, zararlı dosyaları serverınıza atmışlar anladığım kadarı ile.
Bundan sonra istediğiniz kadar güvenlik önlemi alın, pek bir faydasını göremezsiniz.
Önce serverınızdaki zararlı dosyaları temizlemeyi deneyin, temizlendikten sonra işin ehli olanlardan server güvenlik hizmeti almanızı tavsiye ederim ....

Saygılarımla