tam emin olmamakla birlikte (detaylı inceleyecek vaktim şu an yok) sorun kullandığınız jquery eklentisine ait şu koddan çıkıyor:
.stepcarousel .belt{
position: absolute; /*leave this value alone*/
left: 0;
top: 0;
}

position'ı absolute yaptığınız element normal dom ağacından koparak bir üst layer gibi hareket eder.

ne yapabilirsiniz?

ya bu kısmı absolute kullanmadan düzenleyin ya da açılan menülerinizi de position absolute ile kullanarak z-index değerini yükseltin.

bir elemente position z-index uygulamak için onu position absolute ile dom ağacından koparmalısınız.

size tavsiyem bu olabilir.