Bunun için, sitenin site.com'unu www.site.com'a yönlendirmen gerek.

.htaccess dosyası dizininizde varsa onu açın, yoksa o adla bir dosya oluşturun ve içine şunları ekleyin.

Options +FollowSymlinks
RewriteEngine on
rewritecond %{http_host} ^siteninadi.com [nc]
rewriterule ^(.*)$ http://www.siteninadi.com/$1 [r=301,nc]

Böylece sitenize site.com diye girildiğinde www.site.com'a yönlenecek ve artık google sitenin yalnızca www versiyonunu tarayacak.

Google webmaster toolstan işaretleme yapabilirsin. Ancak onun hem garantisi yok ve aylar sürer. Ayrıca, yönlendirmeyi mutlaka yap, bazen duplicate içerik sorunları da çıkarabilir.