config.php dosyasına şu satırları ekle

mysql_query ('SET NAMES CP1251');
mysql_query ('SET COLLATION_CONNECTION=CP1251_GENERAL_CI');

egerki olmazsa sorun düzelmezse phpmyadmin ile yedek alma.
siteden yedek alacaksan bu forumdaki Database kategorisinde scriptler verilmişti onlar ile yedek alıp yine aynı scriptler ile upload yaparsan sorun kalmaz.