Random ile yapabilirsin değişkenleri kullanarak ama kesin olarak 1000 1000 hit göndeceğini sanmıyorum...

<?
$site[0] = "https://www.r10.net";
$site[1] = "http://www.google.com";
shuffle($site);
header("Location: ".$site[0]);
?>


Bu kodları popup.php adlı bir sayfaya kaydet ve sitenin header kısmına sp2 delen bi popup kodu ile bu sayfayı açtır...Her açılmada farklı site açılcaktır...

$site[1] bu kısmı 2 3 4 .... diye artırıp gidebilirsin...