Yukarda yazdığım gibi gayet güzel çalışır arkadaşın dediği gibi muhtemelen .htacces dosyasını atmayı unutmuşsundur.Seo'yu kurarken hangi aşamaları yapıyordun tekrar kontrol et.Belirli dosyalara chmod değeri vermen gerekiyor.Ftp yedeğini yükledikten sonra bunları chmod ver.Kolay gelsin.