cevabı zaten kendiniz vermişsiniz.

.htaccess dosyasında ki şu kodları kaldırın.

#RewriteCond %{HTTP_HOST} ^www\.siteadi.com\.tr$ [NC]
#RewriteRule ^.*$ http://siteadi.com.tr%{REQUEST_URI} [R=301,L]

www.siteadi.com , siteadi.com a yönlendirilmiş bu yüzden www ile denediğiniz zaman bazı fonksiyonlarda hata alabilirsiniz. Çok gereksiz bir yönlendirme olmuş.

Ayrıca şimdi aklıma geldi.

</head> tagından önce ;

<base href="http://www.siteadi.com/">

ekleyip de deneyebilirsiniz.