Bu Çözüm olamaz gibi düşünüyorum çünkü adam shell veya perl dosyalari ile baglaniyorsa db bilgileri oldugu klasörü bilgisayarına indirip zaten istediği gibi okuyabilir.
sölediğiniz mantikli chmod 400 veya 444 vererek okumayi engellersiniz ama bu çözüm değil .
mysql portunu değiştirmek birnevi çözüm olabilir.