bu tür virüsler genellikle index.php, home.php gibi default adreslere bulaşır.
Bu tür dosyaları teker teker kontrol edip kodları temizleyebilirsin.
Ama en garanti yol
grepWin ya da Notepad++ gibi bir programla tüm dosyaları taratman ve virüsü temizlemen.
onun dışında, eğer dosyalarda herhangi bir değişiklik yapmadıysan (phpbb mod kurulumu gibi) scripti 0'dan indirip sunuya göndermen de sorununa çözüm olacaktır.
(ben her iframe bulaşan wp sitemi bu şekilde düzeltiyorum)